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:開(kāi)發(fā)新型熒光RNA傳感器,能監(jiān)測(cè)代謝物、外源藥物、蛋白與金屬離子等靶標(biāo)!

更新時(shí)間:2025-03-11   點(diǎn)擊次數(shù):469次

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【:開(kāi)發(fā)新型熒光RNA傳感器,能監(jiān)測(cè)代謝物、外源藥物、蛋白與金屬離子等靶標(biāo)!】

基因編碼的熒光傳感器可以在單細(xì)胞水平追蹤代謝物、蛋白質(zhì)或重金屬離子等細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo)的豐度變化和動(dòng)力學(xué)分布,并解析活細(xì)胞的生理過(guò)程和信號(hào)傳導(dǎo)通路。該團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一類(lèi)基因編碼的新型熒光RNA傳感器。該傳感器能夠在活細(xì)胞中監(jiān)測(cè)代謝物、外源藥物、蛋白與金屬離子等靶標(biāo),展現(xiàn)出高通量、高內(nèi)涵藥物篩選的潛力。?

傳統(tǒng)的基因編碼傳感器由熒光蛋白和結(jié)合靶標(biāo)的蛋白模塊組成。然而,由于多數(shù)靶標(biāo)缺乏對(duì)應(yīng)的蛋白模塊,科學(xué)家難以構(gòu)建基于熒光蛋白的傳感器。此外,基于熒光蛋白的傳感器還有信噪比低等缺陷,限制了熒光蛋白傳感器的應(yīng)用。?

近年來(lái),基于熒光RNA的傳感器發(fā)展迅速。熒光RNA傳感器由熒光RNA與結(jié)合靶標(biāo)的RNA模塊組成。二者通過(guò)一個(gè)短莖連接。該短莖稱(chēng)為傳導(dǎo)模塊(transducer module),其熱力學(xué)穩(wěn)定性由靶標(biāo)識(shí)別適配體調(diào)節(jié)。靶標(biāo)與結(jié)合靶標(biāo)的RNA模塊結(jié)合,誘導(dǎo)RNA構(gòu)象變化,調(diào)控?zé)晒釸NA適配體的熒光強(qiáng)度,從而檢測(cè)靶標(biāo)信號(hào),解析其在活細(xì)胞中的信號(hào)通路。然而,這些熒光RNA傳感器通常含有RNA G四鏈體(RG4)結(jié)構(gòu)。RG4結(jié)構(gòu)可被活細(xì)胞解旋酶靶向,導(dǎo)致RNA的解旋或降解,故限制了含RG4的熒光RNA傳感器在活細(xì)胞中的應(yīng)用。?

為此,李幸團(tuán)隊(duì)通過(guò)系列實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),研發(fā)了不包括RG4的熒光RNA傳感器。研究選擇使用了Pepper熒光適配體。Pepper不含RG4結(jié)構(gòu),避免了被細(xì)胞酶降解或解旋。此外,Pepper亮度高、穩(wěn)定性強(qiáng),并能夠結(jié)合不同小分子探針產(chǎn)生不同顏色的熒光?;诖?,李幸團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了一系列基于Pepper的生物傳感器。進(jìn)一步,實(shí)驗(yàn)表明這些傳感器不包含RG4結(jié)構(gòu),并可以高效監(jiān)測(cè)活細(xì)胞中的內(nèi)源小分子代謝物、外源藥物、蛋白質(zhì)和金屬離子等多種靶標(biāo)。該研究發(fā)展的基于RNA傳感器用于檢測(cè)人體細(xì)胞內(nèi)的金屬離子,為探索人體活細(xì)胞金屬離子提供了新型基因編碼工具

該團(tuán)隊(duì)基于Pepper的生物傳感器,探討了甲基化代謝物S-腺苷(S-adenosyl methionine,SAM)代謝通路,測(cè)定了靶標(biāo)藥物活性。研究將Pepper與SAM適配體融合,構(gòu)建出低背景、高響應(yīng)、高選擇性的SAM傳感器。進(jìn)一步,該工作探究了單細(xì)胞中SAM合成的代謝來(lái)源,解析了SAM合成酶(methionine adenosyltransferase,MATase)的酶活性和基因表達(dá)水平。此外,該工作還構(gòu)建了監(jiān)測(cè)SAM的比率傳感器。該傳感器精確定量了MATase的酶活性,并準(zhǔn)確測(cè)定了MATase抑制劑AG-270的半抑制濃度(IC50)。該工作發(fā)展熒光RNA傳感器來(lái)準(zhǔn)確測(cè)定活細(xì)胞中的藥物IC50,為研發(fā)基于RNA的藥物篩選平臺(tái)驗(yàn)證了可行性,并提供了高效的MATase酶藥物篩選工具

該團(tuán)隊(duì)為追蹤活細(xì)胞內(nèi)靶標(biāo)及其信號(hào)傳導(dǎo)途徑提供了高效的生物傳感平臺(tái),在藥物篩選和疾病診斷等領(lǐng)域具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金等的支持。?


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